目前，国家和地方政府都非常重视长江流域湿地的保护，并取得显著成绩。但面积萎缩、物种减少和监管不力等突出问题令人堪忧。为此，建议：

一、科学调控水利工程，破解湿地面积萎缩困局。建议深入研究三峡大坝和南水北调工程的运营问题，科学调控三峡库区水位、南水北调水量，在基本满足发电和调水要求的基础上，充分考虑长江流域湿地生态保护的要求，统筹水利工程和湿地保护、兼顾经济开发和生态建设，努力破解长江流域水位下降困局，把湿地面积萎缩现象减到最低程度。

二、出台湿地保护法，并因地制宜对症下药。我国湿地数量众多、分布广泛，在保护、恢复过程中面临的问题和困难千差万别。建议国家在出台湿地保护法的基础上，争取对列入国家湿地保护名录的重要湿地实行“一个湿地一部法律”，因地制宜对症下药，达到有效保护目的。如，湖南洞庭湖湿地、湖北洪湖湿地和海南东寨港红树林湿地在保护过程中要严禁工业污水、农药化肥、生活垃圾以及围网养鱼、填湖开发等对湿地的污染和破坏。洞庭湖要特别注意缩短枯水期以免威胁部分物种的生存；洪湖要严厉打击“地笼”捕鱼现象等；东寨港红树林要坚决杜绝林下养鸭以免危及红树自身的生命安全。